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昆明植物園始建于1938年，隸屬于中國科學院昆明植物研究所（下稱：昆明植物研究所）。昆明植物園立足我國云南高原，面向西南山地和橫斷山南段，是以引種保育云南高原和橫斷山南端地區的珍稀瀕危植物、特有類群和重要經濟植物等為主要內容，以資源植物的引種馴化和種質資源的遷地保護為主要研究方向，集科學研究、物種保存、科普與公眾認知為一體的綜合性植物園。園區開放面積44公頃，分為東、西兩個園區，已建成了山茶園、巖石園、竹園、水景園（單子葉植物園）、中烏全球蔥園、羽西杜鵑園、觀葉觀果園、報春鳳仙專類園、百草園、薔薇園、紀念樹園、極小種群植物專類園、殼斗園、金縷梅園、扶荔宮溫室群、木蘭園、裸子植物園等17個專類園（區），收集保育植物7000余種和品種。建園以來，獲省部級以上獎勵40項，發表論文600余篇，獲授權發明專利50余項，注冊植物新品種100余個，出版專著60余部。昆明植物園先后被命名為“全國科普教育基地”、“云南省科學普及教育基地”、“全國青少年走進科學世界科技活動示范基地”、“全國青少年科技教育基地”、“昆明市科普精品基地”等；山茶園榮獲“國際杰出茶花園”稱號。昆明植物園現為國際茶花協會主席掛靠單位。
    昆明植物所曾于1958年—1974年在玉龍雪山南麓籌建麗江植物園（后來停辦）。2001年，昆明植物所與英國愛丁堡植物園、云南省農業科學院麗江高山經濟植物研究所合作，開始復建麗江高山植物園。復建的麗1江高山植物園位于麗江玉龍雪山南麓哈里谷，該園園區規劃面積4300余畝，海拔2600 — 4300米，有原生植物2300余種。2010年底，昆明植物研究所與與麗江市人民政府、云南省農業科學院麗江高山經濟植物研究所、中國科學院昆明昆明動物研究所、中國科學院西雙版納熱帶植物園等機構，在麗江高山植物園玉龍雪山野外工作站基礎上，聯合籌建江森林生態系統定位研究站。2014年，昆明植物研究所進行了研究系統和支撐系統部門調整，形成“三室一園一庫”的科研機構布局，麗江高山植物園及其麗江森林生態系統定位研究站納入昆明植物園管理。
    “十二五”期間（2011年-2015年），昆明植物園共主持（包括參與主持）承擔國家自然科學基金重點項目/NSFC-云南聯合基金重點項目、中國科學院重點部署項目、國家科技重大專項、國際合作、地方委托等各類項目100余項；積極參與推動極小種群野生植物（Plant Species with Extremely Small Populations，簡稱：PSESP）“搶救性保護”在政府層面行動計劃的制定，引領了中國極小種群野生植物的系統研究、保護實踐與示范；發表學術論文180余篇，其中在Annals of Botany, Biodiversity and Conservation, BMC Plant Biology, Conservation Biology, Mycorrhiza, Scientific Reports等國際重要SCI刊物上發表的論文136篇，出版專著4部，培育具有自主知識產權的植物新品種25個；申請發明專利、相關標準或規范計24件。 五年間，新建植物專類園2個，完成了占地35畝的“扶荔宮”溫室群的改擴建，還對7個專類園進行了景觀優化與改造提升；新建氣象站，完善了植物數據采集及物候觀測記錄體系；引種植物2449號超過1000種。到昆明植物園開展科研觀察、教學實習、科普活動和觀光休閑的人數，從2011年的479051人次增加到2015年的912598人次（2015年比2011年增加了433547人次），累計入園人數達到了357萬人次。
    “十三五”（2016年-2020年）期間，昆明植物園將圍繞已經收集或將要收集保存的重要植物類群（國家重點保護植物、極小種群野生植物、生態系統中關鍵類群、野生經濟植物等）的有效保護、馴化利用的基礎理論與關鍵技術、園林園藝與植物景觀構建模式等，開展系統深入的研究，特別是極小種群野生植物有效保護的基礎理論和關鍵技術集成體系的系統研究、以及特色資源植物（環境改善類、藥用保健類、觀賞花卉）評價與應用研究；加強植物綜合保護生物學團隊、植物馴化生物學團隊、植物資源評價與高效繁育技術集成利用團隊、植物色香味與動物關系團隊等研究隊伍建設，并注重培養和建立一支具有扎實專業理論與技術知識、實踐經驗豐富、結構優化的植物園人才隊伍；全力推進 “數字化植物園”建設，完善活體收集的信息記錄，建立系統的物候觀測體系；在充分挖掘現有植物園專類園的物種保育功能的同時，增加2-3個專類園，保育物種達到萬種。通過5年的努力，將昆明植物園真正建成我國西南重要資源植物的遷地保育中心、引種馴化基地和科普旅游殿堂，成為特色鮮明的著名綜合性植物園；把麗江高山植物園建成中國 — 喜馬拉雅地區高山、亞高山地區，集生物多樣性監測、植物種質資源保育和持續利用為一體的區域特色植物園；麗江森林生態系統定位研究站爭取進入中國科學院或國家野外臺站行列。
 


△薔薇園

△扶荔宮

△金縷梅園·楓香大道一角

△巖石園

△觀葉觀果園·植物迷宮

圖片出自昆明植物園